Liitto tehosti aluetyötään 1986 alkaneella aluesihteerikokeilulla. Ensimmäiset aluesihteerit aloittivat Oulussa ja Rovaniemellä. Verkko täydentyi myöhemmin Itä-Suomen, Keski-Suomen, Länsi-Suomen ja viimeisimmäksi Etelä-Suomen aluesihteerillä. Liitolle muotoutui viisi toiminta-aluetta, joissa aluesihteereiden työ edisti yhdistysten ja jäsenmäärän lisääntymistä. Reumaliitossa oli vuonna 1995 jäsenyhdistyksiä 162 ja niissä jäseniä 48 998.
Suomen Reumaliitto perusti vuonna 2008 kahdeksan aluetoimikuntaa ja muutti aluesihteereiden nimikkeet aluekoordinaattoreiksi. Yhdistystoiminnan pääpaino oli liiton vuonna 2007 hyväksytyn aluestrategian mukaan aluetoimintojen kehittämisessä. Liitto keskitti voimiaan yhdistysten toimintaedellytysten lisäämiseen ja yhdistysten vapaaehtoisten jaksamiseen.
